R_language

R的一些基础练习与操作和一些常用包的操作练习

Install R

Install in Linux platform

$ sudo yum install epel-release
$ sudo yum update
$ sudo yum install R

Install in CentOS (integrant install packages)

$ sudo yum install libcurl-devel
$ sudo yum install openssl-devel
$ sudo yum install libxml2-devel

Creat users and insert sudoers

$ sudo adduser apple
$ sudo passwd apple
vm /etc/sudoers 找到 root ALL=(ALL) ALL 在这行下边添加 dsg ALL=(ALL) ALL

Install rstudio-server

官网链接地址

1. 64bit Install

$ wget https://download2.rstudio.org/rstudio-server-rhel-1.1.383-x86_64.rpm
$ sudo yum install --nogpgcheck rstudio-server-rhel-1.1.383-x86_64.rpm

2. 32bit Install

$ wget https://download2.rstudio.org/rstudio-server-rhel-1.1.383-x86_64.rpm
$ sudo yum install --nogpgcheck rstudio-server-rhel-1.1.383-x86_64.rpm

Start Rstudio Server

sudo iptables -I INPUT -p tcp --dport 8787 -j ACCEPT # 有可能防火墙未打开8787端口，需要手动开启
#查看是否安装正确
sudo rstudio-server verify-installation

## 启动
sudo rstudio-server start

## 查看状态
sudo rstudio-server status

## 停止
sudo rstudio-server stop

$ sudo rstudio-server active-sessions 
$ sudo rstudio-server suspend-session <pid>
$ sudo rstudio-server suspend-all
$ sudo rstudio-server offline # 会给当前连接用户下线提示
$ sudo rstudio-server online

## 查看服务端ip地址
ifconfig

用google浏览器打开http://you.ip:8787 然后输入用户名和密码，和登录服务器时的用户名和密码一致。

R packages （安装r包能让所有用户使用）

强烈建议使用root用户或者sudo R进入R安装各种包，使包能被安装至 /usr/lib64/R/library/

多数包可以通过:

install.packages("ggplot2",repos = "http://cran.rstudio.com/",lib ="/usr/lib64/R/library/")

的方式安装，但是有的包如Rcpp或者httpuv等还是会报无法编译的错，可以先查看:

yum list R-\

是否包含需要安装的包，如果有就直接yum install PACKAGE_NAME，此外也可以使用如下办法安装：

wget http://cran.r-project.org/src/contrib/Rcpp_0.11.1.tar.gz
sudo R CMD INSTALL --build Rcpp_0.11.1.tar.gz

wget http://cran.r-project.org/src/contrib/httpuv_1.2.3.tar.gz
sudo R CMD INSTALL --build httpuv_1.2.3.tar.gz 

Fedora提供了一些r软件包的选择。更有限这些软件包的选择已经被移植到了。rpm的名字是 通过添加前缀“r-”从r包名得到。因此全部r-related rpms可以用yum命令列出

yum list R-\*

shiny-server的安装

sudo su - \
-c "R -e \"install.packages('shiny', repos='https://cran.rstudio.com/')\""
$ wget https://download3.rstudio.org/centos5.9/x86_64/shiny-server-1.5.6.875-rh5-x86_64.rpm
$ sudo yum install --nogpgcheck shiny-server-1.5.6.875-rh5-x86_64.rpm
$ sudo start shiny-server
$ sudo stop shiny-server
$ sudo restart shiny-server # restart模式不会读取/etc/init/shiny-server.conf中的改动