circBase
circBase其实只是简单地对几篇文章的circRNA进行了汇总，最初包含Memczak、Salzman等达人在2013年发表的circRNA大规模识别的先锋作品，随后陆续更新了一些文章。数据库中circRNA识别的方法多种多样，但主要是Memczak的find_circ流程。
circBase的初衷可能是想像mirBase一样对circRNA的命名等基本信息进行统一规范化。但目前circRNA并没有统一的命名，一般使用基因组位置作为名字，或者用circ-作为前缀而宿主symbol作为后缀（例如， circ-CDR1)，对于一些个别的circRNA研究，研究者都愿意用自己的设计，例如CDR1as——与lncRNA命名相似（一些研究者认为circRNA也算是长的非编码RNA，但circRNA是否编码蛋白质目前还有待进一步考证）。
理想很丰满而现实很骨感，由于实验技术以及识别方法的缺憾[^1][^2],circBase提供的circRNA的信息在进行进一步研究时还需要特别注意，特别是对结构以及表达的评估。
circBase提供了基因组位置、细胞系或组织、参考文献等信息，还提供了circRNA序列查询及下载功能，另外研究者可以获取到circRNA剪切掉中间内含子后的序列（由于circRNA的识别工具只能识别junction即环状剪接位置，而中间的序列无法完全确定，所以这里的circRNA完整序列还只是作者的假设）。
当然，数据库还提供了find_circ的程序，但推荐去github下载最新版本。
circBase的作者动作很快，抢注了这样一个非常好的域名，但要想circRNA像miRNA那样具有规范及精确的定位，还需要研究者的进一步研究，至于该网站能不能成为circRNA真正的base，让我们拭目以待！
circBase的使用请参考原文Glažar, et.al., 2014。
另外也可以查看微信公众号的文章环状RNA常用数据库
ps我不是托，只是该公众号确实方便用汉语跟踪研究进展。