Skip to content

Regrouper les résultats du nouveau criblage en attendant les open data

Notifications You must be signed in to change notification settings

flodebarre/nouveauCriblage

Folders and files

NameName
Last commit message
Last commit date

Latest commit

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

Repository files navigation

nouveauCriblage

Avec les données ouvertes

Les données de criblage sont enfin disponibles sur data.gouv.fr.

Le code pour tracer les figures est ici.

La sortie HTML permettant de voir les figures est .

Avant les données ouvertes

Motivation

Les open data du nouveau criblage ne sont toujours pas disponibles. Selon Guillaume Rozier qui a interpelé Olivier Véran sur Twitter, les données devraient arriver jeudi. En attendant, des données sont publiées sur la page variants de Santé Publique France. La page est sauvegardée sur WayBack Machine, et on peut donc retrouver les données des jours précédents.

Les voici donc regroupées dans un fichier .csv, en attendant les open data

Format des données

Column name Content
location Echelle géographique (si on a le courage d'entrer les données régionales)
nbCriblage Nombre de résultats de criblage saisis en nouvelle nomenclature
propTest Proportion des tests (TAG et PCR) positifs qui sont criblés
nbXXX Nombre de résultats positifs pour la mutation XXX
pXXX Pourcentage parmi les PCR criblées en nouvelle nomenclature où la mutation XXX est recherchée
nbE484KandL452R Nombre de résultats où les deux mutations sont recherchées (NA)
source source of the data

Crédits

@rozieres pour l'idée d'utiliser WayBack Machine
@touna14 pour les données 8-14 juin

About

Regrouper les résultats du nouveau criblage en attendant les open data

Resources

Stars

Watchers

Forks

Releases

No releases published

Packages

No packages published