advancedSingleCell

对单细胞测序的学习，跟着流程走‘CNS图表复现’走

jimmy的单细胞课程

高级分析

• 单细胞转录组高级分析一：多样本合并与批次校正
• 单细胞转录组高级分析二：转录调控网络分析
• 单细胞转录组高级分析三：细胞通讯分析
• 单细胞转录组高级分析四：scRNA数据推断CNV
• 单细胞转录组高级分析五：GSEA与GSVA分析
• 单细胞转录组高级分析六：TCGA生存分析
• 单细胞转录组高级分析七：整合scATAC数据
• 单细胞转录组高级分析八：整合V(D)J数据

Tips for integrating large datasets

https://satijalab.org/seurat/articles/integration_large_datasets.html

数据下载： https://data.humancellatlas.org/explore/projects/cc95ff89-2e68-4a08-a234-480eca21ce79/m/expression-matrices?catalog=dcp1