diff --git a/ChangeLog b/ChangeLog index f2164a9..02c624a 100644 --- a/ChangeLog +++ b/ChangeLog @@ -11,11 +11,28 @@ ################################################################################ # IntaRNA -- BUGFIX : seed order check was buggy ################################################################################ ################################################################################ + + +################################################################################ +### version 3.4.1 +################################################################################ + +# IntaRNA +- BUGFIX : seed order check was buggy +- BUGFIX : explizit seed : wrong direction of query base pair parsing (thanks to Tim15-tech) + +################################################################################ +################################################################################ + +240918 Martin Raden + * IntaRNA/SeedHandlerExplicit : + * SeedData() : + + BUGFIX : reversal of dotBar2 was missing + 240430 Martin Raden * IntaRNA/PredictorMfeEns : * updateZ() diff --git a/src/IntaRNA/SeedHandlerExplicit.cpp b/src/IntaRNA/SeedHandlerExplicit.cpp index 8583083..11d0a43 100644 --- a/src/IntaRNA/SeedHandlerExplicit.cpp +++ b/src/IntaRNA/SeedHandlerExplicit.cpp @@ -349,6 +349,8 @@ SeedData( const std::string & seedEncoding, const InteractionEnergy & energyFunc // seed exceeds sequence end start2 = std::string::npos; } + // reverse dotBar2 + std::reverse(dotBar2.begin(), dotBar2.end()); } }